自从霸仙尊沈异无敌三界十万年以来，平静许久的仙宫出现了一件奇事：霸仙尊竟然自丹田中孕育出一个女儿——霖霖。这一年，四岁半的霖霖提出想见妈妈，霸仙尊便带着她横渡星河，前往蓝星探寻这件全宇宙数亿年不曾出现之事。就在他们离开仙宫之后，一道埋伏已久的黑暗气息，向这位无敌强者发动了偷袭……

纽约大战后，雷神索尔将弟弟洛基带回仙宫囚禁起来，此外帮助九大国度平定纷争，威名扶摇直上。虽然父王奥丁劝其及早即位，但索尔念念不忘地球的美丽女孩简·福斯特。与此同时，简在和黛西及其助手伊安调查某个区域时意外被神秘物质入侵，却也因此重逢索尔，并随其返回仙宫。令人意想不到的是，藏在简体内的物质来自远古的黑暗精灵玛勒基斯。在“天体汇聚”的时刻再次到来之际，玛勒基斯企图摧毁九大国度，缔造一个全然黑暗的宇宙。藏匿简的仙宫受到重创，而索尔和洛基这对冤家兄弟也不得不联手迎战宿命的强敌……